IRODS

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Service iRODS

Paramètres du service iRods de MUST

  • la zone s'appelle mustZone
  • la ressource par défaut est must1Resc
  • le serveur est lapp-irods.in2p3.fr
  • le port est 1247

Configuration de votre environnement sur lappudsX

Connectez vous par ssh sur la machine lappudsX.in2p3.fr (X = 4 par exemple).

Dans votre zone home, sous le dossier .irods, vous devez créer un fichier irods_environment.json qui doit ressembler à :

Le fichier peut être créé initialement par la commande iinit mais, dans tous les cas , les trois dernières lignes doit être ajoutées manuellement.


{

   "irods_host": "lapp-irods.in2p3.fr",
   "irods_port": 1247,
   "irods_user_name": "votre_login",
   "irods_zone_name": "mustZone",
   "irods_home": "/mustZone/votre_labo",
   "irods_cwd": "/mustZone/votre_labo",
   "irods_authentication_scheme": "PAM"

}

Vous devez configurer le répertoire de travail par défaut sur la collection de votre labo sur laquelle vous avez un quota suffisant (paramètres irods_home et irods_cwd)

Votre mot de passe est celui de votre compte MUST.

Quelques commandes de base pour tester rapidement

Sur les serveurs lappudsX, les commandes clientes iRods sont disponibles.

  • iinit : pour initialiser votre environnement et saisir votre mot de passe de session
  • ils  : pour voir la liste des objets et collections
  • iput : pour déposer un objet
  • iget : pour récupérer un objet
  • icd : pour changer de dossier (collection)
  • ipwd : pour voir le dossier en cours

Aide sur les commandes utilisateur

Voir le site officiel : https://docs.irods.org/4.2.1/icommands/user/

Connexion depuis une autre machines Linux

Vous devez installer le package client iCommands pour disposer des commandes du client iRods.


Client pour WINDOWS

Utiliser CYBERDUCK pour windows : https://cyberduck.io/ , il faut configurer un signet cf: https://irods.org/2015/09/howtocyberduck/

Attention, pour utiliser le mot de passe Must il faut ajouter "PAM:" devant le nom d'utilisateur (authentification PAM).

Comment obtenir un compte sur le service

Vous devez tout d'abord posséder un compte MUST puis demander un accès au service iRODS à support-usmb@lapp.in2p3.fr

Forum Google sur iRODS

https://groups.google.com/forum/m/#!forum/iROD-Chat

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